Молодой парень Хидеки приезжает в Токио, чтобы поступить в университет, и сталкивается с повальным увлечением «персокомами» — человекоподобными компьютерами. Он не может себе позволить даже подержанную модель, пока однажды не находит среди выброшенного хлама девушку-андроида невероятной красоты. Он приносит её к себе и называет Чии. Она оказывается совершенно уникальной. Вместо предустановленных программ — лишь детское, неосознанное существование. Она не умеет говорить, только повторяет «Чии»,
Хельга и её младший брат Томас живут в приюте, больше похожем на тюрьму. Доктор Кумагири и его люди в чёрных пальто следят за каждым их шагом. Они не обычные дети. Томас видит обрывки прошлого, его глаза светятся синим. Хельга носит шрам на запястье и скрывает синяки под халатом. Они сбегают под дождём, прячась в грузовике. В городе их находят местные ребята — Синдзи и Акико. Впервые за долгое время у них появляется призрачный шанс на обычную жизнь, на заброшенные качели и украденную
Шестнадцатилетняя Аяко находит на чердаке старую статую Девы Марии с отколотым пальцем. Ночью в её комнате появляется мокрая фигура, капающая солёной водой на пол. Призрак исчезает, оставив на запястье девушки синяк в форме креста. В школе Кейта показывает ей старую фотографию. Та же статуя стоит в руинах сгоревшей церкви Ураками. Он рассказывает о погибшей там монахине-сироте, которая, по слухам, прокляла разрушителей храма. Аяко находит в семейном алтаре тревожное письмо от бабушки с намёком