Клауд Страйф, когда-то сломавший судьбу чудовищного Сефирота, пытается срастись с тишиной. Два года он живёт в сиротском приюте, подальше от крови и боёв. Но прошлое не исчезает: на жителей планеты обрушивается странная хворь Геостигма, а рядом с городом объявляется таинственный Кададж. Его планы явно не сулят добра, и особенно тревожно то, что они завязаны на детях. Клауд хочет защитить мир, который он однажды уже отвоевал, и не дать новой угрозе добраться до тех, кто слабее всех. Однако враг
Деревня в горах горит. Её уничтожил тот, кого считали героем, - Сефирот. Он пришёл сюда вместе с солдатами Заком и Клаудом, но не ради задания. Сефирот ищет свою мать и уходит к реактору Мако, где она хранится. Тифа, дочь местного кузнеца, бросается за ним следом - отец остался в той стороне. Зак и Клауд тоже бегут к реактору. Внутри горы пахнет машинным маслом и чем-то чужим. Тифа находит отца: он сидит на полу и смотрит в одну точку, не мигая.