Япония, начало двухтысячных. Учёные держат в резерве оружие, которого не было полвека назад: ДНК Годзиллы, законсервированное после первого нападения 1954 года. На этих молекулах выращивают органические ткани и встраивают их в гигантского управляемого робота - Механическую Годзиллу. Машина копирует все функции живого монстра и должна защитить страну, если он вернётся. Годзилла просыпается. Он идёт крушить японские города, и теперь у людей нет выбора. Навстречу живой силе выпускают её
Прошел год после схватки с Механической Годзиллой, но океан снова шлет угрозу. На этот раз голос принадлежит Мотре - древнему врагу Годзиллы - и её требование не оставляет выбора. Японии приказано вернуть в пучину всё, что осталось от первого вторжения: кости, ткани, каждую молекулу ДНК. Только так можно купить спокойствие. Но Годзилла уже выходит из воды, и его цель - уничтожить и Мотру, и механического двойника. Человечество оказывается между двумя силами: одна требует искупления, другая
В океане проходят испытания секретного оружия против Годзиллы - корабля «Грифон» и генератора «Приливная волна». В тот же день из глубин поднимаются Мегануроны, гигантские насекомые, питающиеся жизненной энергией человека. Их королева Мегагирус высотой с небоскрёб нацелилась на самого ящера, чтобы высосать его радиоактивную силу. Учёные понимают: их творения бессильны против роя. Люди оказываются зажаты между двумя чудовищами, каждое из которых способно стереть город. Исход схватки титанов